安农茶学:茶树基因组研究取得新突破,我国栽培茶树的西南起源学说再获支持
近日,安徽农业大学茶树生物学与资源利用国家重点实验室获得了茶树(Camelliasinensisvar.sinensis)染色体级别的高质量参考基因组,并揭示了栽培茶树适应性进化机制,相关研究成果以题为“Thereferencegenomeofteaplantandresequencingof81diverseaccessionsprovideinsightsintogenomeevolutionandadaptationofteaplants”发表于国际植物学著名期刊MolecularPlant(IF=10.8)。 这是该实验室宛晓春和韦朝领研究团队近两年继发布中国种茶树基因组草图(PNAS,2018,115(18):E4151-E4158)并成功构建茶树基因组学与生物信息学分析平台(PlantBiotechnologyJournal,2019,17(1):1938-1953)后,在茶学生物学基础领域取得的又一项重大标志性研究成果。
该研究以国家级茶树品种舒茶早(中国种)为材料,利用单分子测序(PacBio)和染色体构象捕获(Hi-C)技术,克服了茶树基因组庞大、高杂合与高重复等组装困难,获得染色体级别的茶树高质量参考基因组序列,其ContigN50为600Kb、ScaffoldN50为167Mb、BUSCO完整性得到94%,与前期报道的茶树基因组草图相比,该基因组组装的准确性与完整性都得到极大的提升。
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- 编辑:茶博士
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